PGS. TS. BS Trần Lê Linh Phương tốt nghiệp Đại Học Y Dược, TP. HCM năm 1989, nhận bằng Chuyên khoa cấp I ngành Tiết niệu năm 1993, Thạc sĩ Y học năm 1999, Tiến sĩ Y học năm 2004 cũng tại ngôi trường này. Đến năm 2007, bác sĩ Linh Phương vinh dự được phong Phó Giáo Sư Y học, Hội đồng Chức Danh Giáo Sư Nhà Nước.

Ngoài ra, bác sĩ Trần Lê Linh Phương còn tham gia các khóa đào tạo nâng cao ở nước ngoài như: Thận học và ghép thận (1994-1995), Kỹ thuật nội soi ổ bụng nâng cao trong Tiết niệu (2003), Phẫu thuật nội soi Tiết niệu (2005), Phẫu thuật nội soi cắt tuyến tiền liệt tận gốc và phẫu thuật nội soi lấy thận ghép (2006), Phẫu thuật Ung Thư hệ Niệu (2008).

Với hơn 30 năm kinh nghiệm, bác sĩ Trần Lê Linh Phương được xem là một trong những chuyên gia đầu ngành và có chuyên môn cao trong điều trị sỏi tiết niệu và các bệnh lí liên quan đến: sỏi thận, ung thư đường tiết niệu, phụ khoa – tiết niệu. Ngoài ra, bác sĩ Trần Lê Linh Phương có thể thực hiện tất cả các kỹ thuật mổ lấy sỏi hiện nay như tán sỏi ngoài cơ thể, tán sỏi nội soi ngược dòng, lấy sỏi thận qua da, phẫu thuật nội soi lấy sỏi…