Bác sĩ Nguyễn Văn Thọ tốt nghiệp Đại học Y Dược TP.HCM năm 2000, bác sĩ nội trú bệnh viện chuyên ngành Lao và Bệnh Phổi năm 2004 và Thạc sĩ Y học, Đại học Y Dược Thành phố Hồ Chí Minh năm 2008. Sau đó, bác sĩ Nguyễn Văn Thọ tiếp tục tu nghiệp và trở thành Tiến sĩ Y học, Đại học Y Khoa Shiga, Nhật Bản năm 2015. Ngoài ra, bác sĩ Thọ còn tham gia khóa đào tạo nâng cao về Hô hấp và Chăm sóc đặc biệt tại Bệnh viện Đa Khoa Singapore năm 2007 và từng nhận học bổng Harasawa của Hiệp hội Hô hấp Nhật Bản để học tập và nghiên cứu tại Khoa Hô hấp Đại học Y Khoa Shiga, Nhật Bản năm (2009-2010).

Với 20 năm kinh nghiệm cùng chuyên môn vững vàng trong lĩnh vực điều trị bệnh hen suyễn, bệnh phổi tắc nghẽn mạn tính, các bệnh đường hô hấp và hình ảnh học chức năng trong điều trị các bệnh lý lồng ngực,… bác sĩ Nguyễn Văn Thọ đã có thời gian công tác tại Khoa thăm dò chức năng Hô hấp Bệnh viện Đại học Y Dược TP. HCM (từ năm 2003); Bác sĩ điều trị khoa Bệnh phổi tắc nghẽn, khoa Ung Thư Phổi, khoa Lao, khoa Bệnh Phổi không Lao của Bệnh viện Phạm Ngọc Thạch TP. HCM (từ năm 2000) giúp cho nhiều bệnh nhân thoát khỏi bệnh tật và có chất lượng cuộc sống tốt hơn.

Ngoài ra, bác sĩ Nguyễn Văn Thọ còn là một giảng viên lâm sàng (từ năm 2005), hiện là Trưởng Bộ môn Lao và Bệnh phổi Đại học Y Dược TPHCM. Đến tháng 11/2020, bác sĩ Thọ quyết định gia nhập đội ngũ FV và công tác tại khoa Nội Phổi.